Per non aver seguito la corretta procedura di partenza delle prove dopo le FP3 della MotoGP, è stata data a Franco Morbidelli una penalità di tre posti sullo schieamento per il Gran Premio dell'Indonesia.
Il pilota della Yamaha partirà quindi dalla 15ª posizione, Luca Marini sale in 12ª, Marco Bezzecchi in 13ª e Marc Marquez in 14ª.