A Valencia l'olandese Colin Veijer conquista la sua seconda pole position in carriera col crono di 1'38'311. Lo affianca con 4 centesimi di scarto il giapponese Sasaki, che a giochi conclusi per quanto riguarda il titolo mondiale, con questa partenza dalla prima fila punta a difendere il secondo posto in classifica dalle mire del rookie Alonso, a 18 punti di distanza in classifica. Una doppietta in qualifica, quella dei piloti del team Husqvarna, che alza le aspettative del team di poter chiudere questo weekend da campioni, 11 i punti che li separano dall'obiettivo, prendendosi quantomeno una rivincita sul team Leopard che nello scorso weekend del Qatar ha conquistato il suo quarto titolo piloti.
Chiude il terzetto della prima fila il turco Oncu, scalzando l'australiano Joel Kelso, veloce in questo weekend ma il cui futuro è ora incerto dopo la notizia di interruzione del supporto della KTM al team CFMoto. Il rookie della stagione Alonso è invece 5° e fa sua la seconda fila dopo il passaggio dalla Q1. Il neoeletto campione del mondo Masia non riesce a sfondare il muro del 1'38 basso e si accontenta dell'8° posto in terza fila, mentre lo spagnolo Holgado cade con un violento highside in curva 11 e salta la sessione scivolando in 18° posizione.
Quanto agli italiani, è di Stefano Nepa la miglior prestazione del sabato di qualifiche al Ricardo Tormo col crono di 1'39'095 che gli vale l'11° casella in griglia di partenza. Farioli, nonostante un accesso diretto alla Q2, si attesta 14° e si rende protagonista anche di una scivolata finendo nella ghiaia assieme a Yamanaka. Rossi, dopo un passaggio attraverso la Q1, segue il connazionale ed è 15°. Sotto le aspettative infine le prestazioni di Bertelle, che non trova la velocità nella Q1 e chiude 19°. Peccato anche per Fenati, che avrebbe forse sperato in un finale di stagione diverso, posiziona la sua Honda solo 20°.
La classifica: